Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp10O55123 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp10O55123 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp10O55123 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp10O55123 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms