Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom1O54990 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom1O54990 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom1O54990 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom1O54990 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom1O54990 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom1O54990 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms