Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SlkO54988 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SlkO54988 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SlkO54988 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SlkO54988 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SlkO54988 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SlkO54988 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SlkO54988 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SlkO54988 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SlkO54988 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SlkO54988 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SlkO54988 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SlkO54988 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SlkO54988 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SlkO54988 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SlkO54988 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SlkO54988 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SlkO54988 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SlkO54988 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SlkO54988 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SlkO54988 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SlkO54988 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SlkO54988 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SlkO54988 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SlkO54988 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SlkO54988 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SlkO54988 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SlkO54988 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SlkO54988 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SlkO54988 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SlkO54988 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SlkO54988 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SlkO54988 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SlkO54988 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SlkO54988 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SlkO54988 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SlkO54988 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SlkO54988 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SlkO54988 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SlkO54988 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SlkO54988 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SlkO54988 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SlkO54988 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SlkO54988 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SlkO54988 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SlkO54988 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SlkO54988 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SlkO54988 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SlkO54988 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SlkO54988 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms