Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NlkO54949 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NlkO54949 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NlkO54949 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NlkO54949 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NlkO54949 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NlkO54949 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NlkO54949 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NlkO54949 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NlkO54949 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NlkO54949 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NlkO54949 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NlkO54949 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NlkO54949 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NlkO54949 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NlkO54949 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NlkO54949 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NlkO54949 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NlkO54949 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NlkO54949 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NlkO54949 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NlkO54949 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NlkO54949 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NlkO54949 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NlkO54949 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms