Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarce1O54941 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarce1O54941 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarce1O54941 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarce1O54941 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms