Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CaluO35887 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CaluO35887 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CaluO35887 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CaluO35887 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaluO35887 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaluO35887 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaluO35887 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CaluO35887 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CaluO35887 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CaluO35887 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CaluO35887 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CaluO35887 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CaluO35887 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CaluO35887 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CaluO35887 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CaluO35887 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CaluO35887 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CaluO35887 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CaluO35887 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CaluO35887 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CaluO35887 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CaluO35887 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CaluO35887 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CaluO35887 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CaluO35887 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CaluO35887 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CaluO35887 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CaluO35887 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaluO35887 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaluO35887 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaluO35887 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CaluO35887 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaluO35887 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaluO35887 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CaluO35887 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CaluO35887 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CaluO35887 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CaluO35887 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CaluO35887 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CaluO35887 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CaluO35887 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms