Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf18O35714 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf18O35714 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfrsf18O35714 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms