Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppfibp2O35711 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp2O35711 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ppfibp2O35711 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp2O35711 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms