Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaxO35602 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RaxO35602 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaxO35602 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RaxO35602 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaxO35602 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaxO35602 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaxO35602 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaxO35602 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RaxO35602 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaxO35602 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaxO35602 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RaxO35602 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RaxO35602 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RaxO35602 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RaxO35602 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RaxO35602 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RaxO35602 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RaxO35602 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RaxO35602 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaxO35602 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RaxO35602 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaxO35602 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RaxO35602 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaxO35602 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RaxO35602 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RaxO35602 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RaxO35602 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RaxO35602 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RaxO35602 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RaxO35602 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RaxO35602 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RaxO35602 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RaxO35602 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RaxO35602 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RaxO35602 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RaxO35602 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RaxO35602 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RaxO35602 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RaxO35602 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RaxO35602 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.9 ms