Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn1mwO35599 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn1mwO35599 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn1mwO35599 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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