Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Slc18a3O35304 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc18a3O35304 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc18a3O35304 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms