Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebi3O35228 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms