Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx3O35160 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms