Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cldn4O35054 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn4O35054 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn4O35054 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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