Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata2O09100 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gata2O09100 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gata2O09100 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata2O09100 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gata2O09100 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms