Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyth3O08967 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyth3O08967 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyth3O08967 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms