Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckarO08786 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckarO08786 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckarO08786 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckarO08786 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckarO08786 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckarO08786 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckarO08786 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckarO08786 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckarO08786 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckarO08786 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckarO08786 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckarO08786 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CckarO08786 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CckarO08786 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckarO08786 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckarO08786 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckarO08786 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckarO08786 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckarO08786 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckarO08786 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckarO08786 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CckarO08786 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CckarO08786 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CckarO08786 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CckarO08786 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms