Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nfil3O08750 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nfil3O08750 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nfil3O08750 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms