Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp12O08736 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp12O08736 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp12O08736 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casp12O08736 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp12O08736 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms