Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MttpO08601 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MttpO08601 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MttpO08601 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MttpO08601 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MttpO08601 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MttpO08601 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MttpO08601 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MttpO08601 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MttpO08601 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MttpO08601 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MttpO08601 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MttpO08601 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MttpO08601 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MttpO08601 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MttpO08601 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MttpO08601 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MttpO08601 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MttpO08601 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MttpO08601 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MttpO08601 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MttpO08601 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MttpO08601 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MttpO08601 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MttpO08601 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MttpO08601 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MttpO08601 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MttpO08601 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MttpO08601 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MttpO08601 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MttpO08601 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MttpO08601 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MttpO08601 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MttpO08601 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MttpO08601 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MttpO08601 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MttpO08601 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MttpO08601 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MttpO08601 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MttpO08601 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MttpO08601 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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