Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3453K7N724 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3453K7N724 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3453K7N724 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms