Protein–RNA interactions for Protein: K7N6T7

Gm2897, Predicted gene 2897, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2897K7N6T7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm2897K7N6T7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm2897K7N6T7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm2897K7N6T7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms