Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc191J3QQ27 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc191J3QQ27 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc191J3QQ27 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms