Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20795J3QP49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20795J3QP49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20795J3QP49 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20795J3QP49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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