Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp408H7BX78 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp408H7BX78 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms