Protein–RNA interactions for Protein: H3BKT1

Uncharacterized protein C19orf84 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BKT1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H3BKT1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H3BKT1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H3BKT1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H3BKT1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H3BKT1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H3BKT1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H3BKT1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H3BKT1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H3BKT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H3BKT1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3BKT1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3BKT1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3BKT1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H3BKT1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H3BKT1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H3BKT1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H3BKT1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H3BKT1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H3BKT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H3BKT1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H3BKT1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H3BKT1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H3BKT1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H3BKT1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms