Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm29394H3BIW7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms