Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HrcG5E8J6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HrcG5E8J6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HrcG5E8J6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
HrcG5E8J6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
HrcG5E8J6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms