Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r12G5E8G1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmn1r12G5E8G1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.1 ms