Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sclt1G5E861 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sclt1G5E861 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sclt1G5E861 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms