Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933406M09RikG3XA12 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933406M09RikG3XA12 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms