Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zkscan2G3X952 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zkscan2G3X952 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zkscan2G3X952 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms