Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ScaperF8VQ70 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ScaperF8VQ70 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms