Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm3371F7CQW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3371F7CQW8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3371F7CQW8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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