Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd50F7BE84 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ankrd50F7BE84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd50F7BE84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms