Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20538F6Z9R1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20538F6Z9R1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms