Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1bF6V0H0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pagr1bF6V0H0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms