Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3072F6SKY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3072F6SKY8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3072F6SKY8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms