Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Plekhg1F6S200 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Plekhg1F6S200 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plekhg1F6S200 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms