Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm29094F6Q785 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29094F6Q785 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms