Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mcmdc2E9Q956 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms