Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Simc1E9Q6E9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Simc1E9Q6E9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms