Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc121E9Q6D3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc121E9Q6D3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc121E9Q6D3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc121E9Q6D3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc121E9Q6D3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms