Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
8030474K03RikE9Q4Y8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
8030474K03RikE9Q4Y8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030474K03RikE9Q4Y8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms