Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Y8

Gm6811, Predicted gene 6811, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6811E9Q3Y8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm6811E9Q3Y8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm6811E9Q3Y8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6811E9Q3Y8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms