Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tarbp1E9Q368 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tarbp1E9Q368 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tarbp1E9Q368 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms