Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acbd4E9Q289 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acbd4E9Q289 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Acbd4E9Q289 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd4E9Q289 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd4E9Q289 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acbd4E9Q289 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acbd4E9Q289 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acbd4E9Q289 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acbd4E9Q289 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acbd4E9Q289 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms