Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzd2E9Q1M1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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