Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B5

Fcgbp, Fc fragment of IgG-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FcgbpE9Q0B5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FcgbpE9Q0B5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FcgbpE9Q0B5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FcgbpE9Q0B5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms