Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm4450E9Q007 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm4450E9Q007 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm4450E9Q007 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm4450E9Q007 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm4450E9Q007 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm4450E9Q007 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms